MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methylophaga sp. JAM1 chromosome

Total Repeats: 60963

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017857	TGCAA	2	10	25608	25617	40 %	20 %	20 %	20 %	387125929
502	NC_017857	GTT	2	6	25666	25671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387125929
503	NC_017857	TGC	2	6	25723	25728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387125929
504	NC_017857	ACCAA	2	10	25767	25776	60 %	0 %	0 %	40 %	387125929
505	NC_017857	GCC	2	6	25781	25786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387125929
506	NC_017857	ACC	2	6	25832	25837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387125929
507	NC_017857	CAC	2	6	25961	25966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387125929
508	NC_017857	CCGGA	2	10	26035	26044	20 %	0 %	40 %	40 %	387125929
509	NC_017857	ACA	2	6	26113	26118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387125929
510	NC_017857	ACC	2	6	26126	26131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387125929
511	NC_017857	GATCCA	2	12	26179	26190	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387125929
512	NC_017857	GCTG	2	8	26268	26275	0 %	25 %	50 %	25 %	387125929
513	NC_017857	CAC	2	6	26395	26400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387125929
514	NC_017857	AGC	2	6	26522	26527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387125929
515	NC_017857	GTTG	2	8	26549	26556	0 %	50 %	50 %	0 %	387125929
516	NC_017857	CG	3	6	26615	26620	0 %	0 %	50 %	50 %	387125929
517	NC_017857	TCT	2	6	26631	26636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387125929
518	NC_017857	TCA	2	6	26637	26642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387125929
519	NC_017857	TAA	2	6	26649	26654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387125929
520	NC_017857	CGA	2	6	26668	26673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387125929
521	NC_017857	TCA	2	6	26853	26858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387125929
522	NC_017857	GCC	2	6	26874	26879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387125929
523	NC_017857	AAAC	2	8	26959	26966	75 %	0 %	0 %	25 %	387125929
524	NC_017857	ACT	2	6	26967	26972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387125929
525	NC_017857	TGC	2	6	26990	26995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387125929
526	NC_017857	AC	3	6	27035	27040	50 %	0 %	0 %	50 %	387125929
527	NC_017857	CG	3	6	27204	27209	0 %	0 %	50 %	50 %	387125929
528	NC_017857	TG	3	6	27255	27260	0 %	50 %	50 %	0 %	387125929
529	NC_017857	ATC	3	9	27296	27304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387125929
530	NC_017857	CGG	2	6	27355	27360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387125929
531	NC_017857	A	6	6	27435	27440	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_017857	GTG	2	6	27484	27489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
533	NC_017857	TCA	3	9	27517	27525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387125930
534	NC_017857	CAA	2	6	27526	27531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387125930
535	NC_017857	ATC	2	6	27659	27664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387125930
536	NC_017857	ATC	2	6	27776	27781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387125930
537	NC_017857	TGA	2	6	27798	27803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387125930
538	NC_017857	TAT	2	6	27951	27956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387125930
539	NC_017857	AGA	2	6	27991	27996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387125930
540	NC_017857	CAG	2	6	28112	28117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387125930
541	NC_017857	ACA	2	6	28194	28199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387125930
542	NC_017857	ATC	2	6	28214	28219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387125930
543	NC_017857	TGC	2	6	28230	28235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387125930
544	NC_017857	CAG	2	6	28260	28265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387125930
545	NC_017857	ACT	2	6	28363	28368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387125930
546	NC_017857	GGT	2	6	28393	28398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387125930
547	NC_017857	CTG	2	6	28459	28464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387125930
548	NC_017857	TGC	2	6	28521	28526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387125930
549	NC_017857	TTA	2	6	28615	28620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387125930
550	NC_017857	TA	3	6	28757	28762	50 %	50 %	0 %	0 %	387125930
551	NC_017857	AAC	2	6	28793	28798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387125930
552	NC_017857	ATA	2	6	28853	28858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387125931
553	NC_017857	A	6	6	28902	28907	100 %	0 %	0 %	0 %	387125931
554	NC_017857	TCA	2	6	28951	28956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387125931
555	NC_017857	TCA	2	6	28996	29001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387125931
556	NC_017857	GTT	2	6	29027	29032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387125931
557	NC_017857	CAA	2	6	29115	29120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387125931
558	NC_017857	TTC	2	6	29148	29153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387125931
559	NC_017857	GGC	2	6	29169	29174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387125931
560	NC_017857	TC	3	6	29326	29331	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
561	NC_017857	CAA	2	6	29339	29344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_017857	AAT	2	6	29365	29370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_017857	TAA	2	6	29376	29381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_017857	ATT	2	6	29438	29443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_017857	GGT	2	6	29506	29511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387125932
566	NC_017857	ATT	2	6	29519	29524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387125932
567	NC_017857	TCG	2	6	29555	29560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387125932
568	NC_017857	CAGG	2	8	29608	29615	25 %	0 %	50 %	25 %	387125932
569	NC_017857	A	6	6	29664	29669	100 %	0 %	0 %	0 %	387125932
570	NC_017857	CTG	2	6	29683	29688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387125932
571	NC_017857	CAA	2	6	29710	29715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387125932
572	NC_017857	A	6	6	29714	29719	100 %	0 %	0 %	0 %	387125932
573	NC_017857	ATT	2	6	29728	29733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387125932
574	NC_017857	AAC	2	6	29759	29764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387125932
575	NC_017857	ATC	2	6	29791	29796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387125932
576	NC_017857	T	6	6	29811	29816	0 %	100 %	0 %	0 %	387125932
577	NC_017857	ACG	2	6	29818	29823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387125932
578	NC_017857	CTG	2	6	29836	29841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387125932
579	NC_017857	TGGA	2	8	29879	29886	25 %	25 %	50 %	0 %	387125932
580	NC_017857	CAG	2	6	29968	29973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387125932
581	NC_017857	GAC	2	6	30061	30066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387125932
582	NC_017857	AAT	2	6	30119	30124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387125932
583	NC_017857	GTT	2	6	30182	30187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387125933
584	NC_017857	AGC	2	6	30241	30246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387125933
585	NC_017857	CGGCG	2	10	30256	30265	0 %	0 %	60 %	40 %	387125933
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588	NC_017857	GAA	2	6	30542	30547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387125933
589	NC_017857	AAG	2	6	30660	30665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387125933
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591	NC_017857	CTGAA	2	10	30804	30813	40 %	20 %	20 %	20 %	387125933
592	NC_017857	ATTC	2	8	30822	30829	25 %	50 %	0 %	25 %	387125933
593	NC_017857	GC	3	6	30841	30846	0 %	0 %	50 %	50 %	387125933
594	NC_017857	GGT	2	6	30890	30895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387125933
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596	NC_017857	TTA	2	6	31001	31006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387125933
597	NC_017857	CAG	2	6	31132	31137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387125933
598	NC_017857	ATT	2	6	31152	31157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387125933
599	NC_017857	GGC	2	6	31171	31176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387125933
600	NC_017857	GC	3	6	31233	31238	0 %	0 %	50 %	50 %	387125933
601	NC_017857	AGC	2	6	31284	31289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387125933
602	NC_017857	ACA	2	6	31317	31322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387125933
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607	NC_017857	T	6	6	31523	31528	0 %	100 %	0 %	0 %	387125933
608	NC_017857	TGA	2	6	31539	31544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387125933
609	NC_017857	GGTCA	2	10	31571	31580	20 %	20 %	40 %	20 %	387125933
610	NC_017857	T	6	6	31663	31668	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_017857	GTA	2	6	31737	31742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
612	NC_017857	T	6	6	31753	31758	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_017857	CTA	2	6	31812	31817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_017857	AAAC	2	8	31861	31868	75 %	0 %	0 %	25 %	387125934
615	NC_017857	GT	3	6	32172	32177	0 %	50 %	50 %	0 %	387125934
616	NC_017857	TTC	2	6	32238	32243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387125934
617	NC_017857	CGG	2	6	32260	32265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387125934
618	NC_017857	TGGC	2	8	32268	32275	0 %	25 %	50 %	25 %	387125934
619	NC_017857	GAT	2	6	32276	32281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387125934
620	NC_017857	AAT	2	6	32309	32314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387125934
621	NC_017857	ATCAA	2	10	32316	32325	60 %	20 %	0 %	20 %	387125934
622	NC_017857	GTG	2	6	32379	32384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387125934
623	NC_017857	CTT	2	6	32520	32525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387125934
624	NC_017857	CAT	2	6	32548	32553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387125934
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626	NC_017857	TTG	2	6	32585	32590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387125934
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628	NC_017857	GCC	2	6	32702	32707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387125934
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